Presentació


Aquest any bitsxlaMarató està organitzada per la Facultat d’Informàtica de Barcelona (FIB)Hackers@UPC (organitzadors de HackUPC) i el Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputación (BSC), que s'uneixen per combatre la COVID-19. Després d'una primera edició dedicada a les malalties minoritàries, sumen forces per aturar els efectes de la COVID-19. Es tracta d'una hackathon plena de creativitat, salut i tecnologia, on professorat, personal investigador i qualsevol professional dels àmbits de la salut i de la tecnologia (però també d'altres àrees!), treballaran en equip, durant 3 dies seguits, en línia. Plegats, buscaran i desenvoluparan solucions per fer front a tots els reptes que ens planteja la COVID-19.  

Aquesta Marató ens toca a tothom!
Així que no pots faltar!

La Hackathon inclourà xerrades formatives que no us podeu perdre! I esperem tenir activitats guiades molt interessants! Durant l'últim dia de la Hackathon els equips faran les presentacions i demostracions de les solucions i propostes de solucions obtingudes als reptes plantejats el primer dia. 

I atenció! Hi haurà premis (simbòlics)! I un premi al millor projecte! Encara que totes les solucions que es proposin així com els donatius per la Marató de TV3 seran ja premis pels milions de persones afectades! Totes elles us ho agrairan!


AJUDA’NS AMB UN DONATIU

És clar! També busquem un donatiu! Abans, durant i després de la Hackathon la nostra intenció és col·laborar amb la Marató de TV3, mitjançant el donatiu dels participants, patrocinadors i de tota la comunitat universitària de la UPC i més enllà!

 

Reptes


Estem preparant, imaginant i creant els reptes per aquesta edició. Si ens voleu fer arribar alguna idea o proposta, contacteu amb bitsxlamarato@fib.upc.edu.

A la cerca de pacients similars: l'AI Doctor House conquereix la COVID-19 severa!

Existeix una necessitat urgent per part dels professionals de la salut per accedir d’una manera més eficaç a la informació que és rellevant per a la pràctica clínica. Més del 80% de les dades clínicament significatives no estan estructurades, principalment pel que fa a imatges com les ressonàncies magnètiques i els textos clínics. 
Un dels reptes als quals s’enfronten els metges és el de trobar pacients i casos clínics que mostrin similituds específiques amb un cas determinat (símptomes, diagnòstics, tractaments o altres característiques similars) d’entre la quantitat cada vegada més gran d’històries clíniques, publicacions mèdiques i de complexitat de dades. La detecció de similituds entre pacients o grups de pacients és clau per a la pràctica clínica basada en l'evidència, la selecció de pacients per a assaigs clínics, la priorització de pacients per a la vacunació i la comprensió de la variabilitat en els resultats clínics.
 
Des del punt de vista de la COVID-19, les eines d’IA han de distingir entre pacients amb i sense risc d’un resultat greu per tal de que els metges puguin intervenir ràpidament. Específicament, aquesta tasca té com a objectiu promoure el desenvolupament de sistemes capaços de detectar similituds entre una col·lecció de textos de casos clínics.

Proposen i col·laboren: BSC.

L’objectiu és poder computar i mesurar la similitud entre els pacients representats pel seu cas clínic, és a dir, el text que descriu la seva condició mèdica, morbiditats prèvies, proves mèdiques i tractaments realitzats, diagnòstic o resultat. En principi, aquest escenari tan complex pot abordar-se mitjançant una diversitat de metodologies que abasten des de tècniques de similitud de text utilitzades per a detectar plagi, detecció de conceptes clínics o inclús estratègies de similitud textual semàntica més avançades que s’ocupen del significat del llenguatge natural a través de l’IA.
L’accés a informació de rellevància mèdica amagada en textos clínics és un dels principals reptes pels professionals sanitaris en l’era digital de l’IA. Preguntes como quins són els símptomes dels pacients amb pitjor evolució, enfront de comorbiditats similars, medicaments o procediments són molt difícils de respondre sense processar sistemàticament els textos clínics. Encara més simples, preguntes epidemiològiques com quants dies han transcorregut abans de que apareguessin els símptomes de la COVID-19 o si els pacients havien viatjat a determinades àrees geogràfiques només es poden respondre de manera eficient mitjançant eines informàtiques. Les similituds entre els pacients poden ajudar en el pronòstic, el diagnòstic i la presa de decisions, estalviant
un temps vital als professionals de la salut.
Logo BSC
Logo Plan TL

Tens tos COVID-19? Ajuda’ns a distingir quina tos tens

La tos és una característica més en el els símptomes de la covid. El so de la tos pot ser singular quan es vulgui distingir d’un altre procés infecciós o d’altre tipus. A la UPC volem donar eines a la gent per saber quin tipus de tos tenim i si aquesta és compatible amb una infecció tipus SARS-cov-2. Vols el repte?

Proposen i col·laboren: CREB i CCD.

L’objectiu del repte és aconseguir crear un sistema que pugui informar si els símptomes són compatibles amb SARS-cov-2, a partir de la informació proporcionada per l’usuari, que inclou àudios de tos entre d’altres. Per example, i sense descartar altres solucions, es podria crear un model de machine learning o algorismes fent ús de tècniques de processat de senyal. Després, fes volar la teva imaginació, crea una app, crea el que vulguis. Per fer aquest repte disposaras de dades, la teva imaginació i GPUs del BSC!.
Les proves ràpides i les eines de detecció prèvia poden ser molt útils per contenir brots de la COVID-19. En particular, un instrument de diagnòstic de la COVID-19 basat en sons respiratoris i l’acústica de la tos seria molt desitjable per testejar la població i identificar possibles brots. Qualsevol usuari pot ser testejat de forma àgil i a cost gairebé nul interactuant amb el telèfon mòbil i enregistrant àudios de la tos. A més, aquesta prova es pot fer en països on les proves de PCR són massa costoses, contribuint així a la contenció de la propagació de la pandèmia arreu del món.
Logo CREB
Logo B2SLab
Logo CCD

Caracterització Clínic-microbiologica de la infecció per SARS-CoV-2 a l'edat pediàtrica

Podem reduir el nombre d'infants i adolescents (població pediàtrica) als que s'hauria de realitzar l'estudi microbiològic -associat a costos sanitaris addicionals i generalment molest-? Definir un valor predictiu, agrupat o individualment, dels signes i símptomes clínics associats a la sospita clínica de COVID-19 pot ajudar! Podeu trobar el millor mecanisme (estratègies i algoritmes de detecció) per predir el COVID-19 pediàtric? Aquest és el repte!

A la base de dades s'inclouen tots els nens sospitosos d'haver estat infectats per SARS-CoV-2 visitats en qualsevol dels centres d'atenció primària i serveis d’Urgències participants del projecte COPEDI-CAT a Catalunya. Recopilem dades de diagnòstic demogràfic, epidemiològic, clínic i microbiològic de tots aquests nens.

La recopilació i anàlisi d'aquesta informació es realitza a partir de la base de dades COPEDI-CAT ja disponible a la plataforma digital REDCap ©.

Proposen i col·laboren: Projecte COPEDI-CAT, Vall d’Hebron, BIOCOM-SC

  • Ús d’IA, eines de ciència de dades o crear nous algoritmes per determinar quins símptomes o conjunts de símptomes són predictors d’un cas positiu en nens.
  • Aplicació de tècniques d’IA per detectar patrons de símptomes covid-19 en casos pediàtrics i, si és possible, generar una puntuació. 
  • Exploració de maneres de visualitzar els resultats que permetin una millor comprensió de les conclusions del repte.

  • Els signes clínics i símptomes associats a les infeccions per virus respiratoris no són específics a l'edat pediàtrica.
  • La infecció per SARS-CoV-2 presenta signes clínics i símptomes molt similars a d'altres virus respiratoris estacionals.
  • Durant el període estacional (tardor-hivern-primavera), quan la màxima incidència d’aquestes infeccions víriques respiratòries és elevada, hem de determinar un diagnòstic diferencial més precís tenint en compte el grau de transmissibilitat de la infecció per SARS-CoV-2 i el seu impacte en els contactes de la llar (quarantena i confinament).

Logo Copedi-cat
Logo Vall d'Hebron
Logo biocomsc

Participa


Vols participar d'aquest esdeveniment ple d'idees i reptes, en un entorn creatiu i per una bona causa?

 

 

Programa


A mesura que tinguem informació de les xerrades i altres activitats anirem actualitzant el programa amb més detall.

Divendres 18 desembre

17.00 - 22.00 h

Dissabte 19 desembre

09.00 - 22.00 h

Diumenge 20 desembre

09.00 - 17.00 h 

Patrocinadors


FAQS


L’expressió hackathon ve de les paraules marató i hacker. Es tracta d’un esdeveniment ple de creativitat i tecnologia que és punt de trobada de gent apassionada per la tecnologia i per crear. L’objectiu principal és que amb el temps previst (en aquest cas 3 dies) siguis capaç de resoldre els reptes que et proposem! Els participants podeu treballar en equips per crear qualsevol cosa… literalment qualsevol cosa que vulguis aprendre i construir!

  • Hacker (per resoldre els reptes): estudiantat, professorat, investigadors, i/o qualsevol persona dels àmbits de la salut o la tecnologia. 
  • Mentor (per ajudar als hackers en l'àmbit tècnic):Qualsevol persona qualificada que no vulgui participar com a hacker però que vulgui aportar el seu coneixement es pot apuntar com a mentor/a.
  • Aportant un donatiu econòmic: tothom pot participar i us animem a fer-ho! (abans, durant o després de la Hackathon).

No! En una hackathon també venim a aprendre, qualsevol que vulgui pot participar tot i no tenir experiència en tecnologia. Els teus coneixements sobre altres àmbits poden ajudar a resoldre el repte, així que qualsevol perfil és benvingut.

No cal tenir un equip per participar. Si ja en tens, perfecte! A la hora de fer el registre indica’l. Si no en tens, els dies abans de la Hackathon els organitzadors es posaran en contacte amb tu per proposar-te un equip. Tot i així, el primer dia de la Hackathon es durà a terme una activitat per acabar d’assignar els participants als equips. Si vols, també pots treballar sol!

 

Els equips poden ser d’un màxim de 5 participants.

Aquesta Hackathon no té un cost d’inscripció, però és un acte solidari per recaptar un donatiu per la Marató de TV3. Per això mateix, proposem als participants fer un donatiu en el moment de l’acte. El donatiu orientatiu és de 5 euros, però podeu donar més si voleu... o si no podeu... menys.

Abans, durant i després de la Hackathon, els participants i els equips podran aportar el seu donatiu. Habilitarem un espai per fer el teu donatiu en línia. Ben aviat us indicarem com fer-ho.

Les inscripcions estan obertes des del dia 20 de novembre fins uns dies abans de l’esdeveniment!

Els reptes es poden llegir a l’apartat de reptes d’aquesta web. Si encara no estan disponibles, rebràs un correu electrònic quan estigui tot enllestit perquè els participants pugueu preparar el que creieu convenient. Estigueu atents a les Xarxes Socials per les actualitzacions.

Degut a la situació actual, com la hackathon és online recorrem a certes eines en línia. Pel que fa a  les xerrades utilitzarem Twitch, mentre que durant la hackathon farem servir Discord. Cada equip disposarà d’una sala de Discord privada dins d’un servidor dedicat a l’esdeveniment, de forma que us demanarem que durant l’esdeveniment us quedeu en el servidor. També hi haurà sales per resoldre dubtes dels reptes, així com mentoring i sales de relax… 

Tota la informació i els accessos els rebreu abans de l’esdeveniment.

No! Pots començar a treballar quan vulguis sobre els reptes que tinguem proposats. Consulta sovint la web, el correu electrònic i les XXSS perquè anirem actualitzant i afegint reptes.

La hackaton tindrà lloc el cap de setmana del 18 al 20 de desembre. La informació sobre l’horari la teniu a la secció del programa!

L'objectiu de bitsxlaMarató és recaptar diners per La Marató de Tv3, alhora que es resolen reptes per fer front a la pandèmia. La Marató de TV3 és un projecte solidari que destina totes les donacions obtingudes a la investigació científica de malalties que avui en dia no tenen cura. La malaltia escollida aquest any és la COVID-19.